Biotechnologie und Molekulare Genetik
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Simultane Identifizierung von Organismen und Genen per DNA-Chip
| Das deutsche Lebensmittelrecht schreibt für Milch und
Milchprodukte zahlreiche Qualitätskontrollen vor, u.a. um die
Verbraucher vor Krankheitserregern wie z.B. coliformen Bakterien zu
schützen. Diese Nachweise benötigen z.T. mehrere Tage und sollen deshalb mit Hilfe von DNA-Chips beschleunigt und verbessert werden. Für die praxisorientierte Entwicklung eines Chip-basierten Analysesystems für die Milchindustrie stehen derzeit mehr als 130 Sonden für die spezifische Identifikation von Bakterien, Phagen und produktspezifischen Genen zur Verfügung. Neben den für die Fermentation wichtigen Bakterien der Gattung Lactococcus können humanpathogene Organismen wie Salmonellen, Listerien, coliforme Bakterien, Staphylokokken oder Pseudomonaden nachgewiesen werden. Da die Hauptursache für Fehlfermentationen Starterkultur-lysierende Phagen bzw. mangelnde Phagenabwehr der Starterbakterien sind, wurden auch Sonden für die 3 wichtigsten Phagenspezies 936, P335 und C2 sowie verschiedene Phagenresistenzgene in den Testumfang des DNA-Arrays aufgenommen Im folgenden ist beispielhaft die Auswahl Organismen-spezifischer Sondensequenzen für den Einsatz in den Microarrays dargestellt.
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